在拥有家族性乳腺癌卵巢癌的波兰患者中,

关键信息：本研究中确定了两个突变，即QX（BRCA1）和NI（BRCA2），为确定波兰乳腺癌/卵巢癌患者的遗传风险奠定了基础。

目的

与全基因组检测相比，对BRCA1和BRCA2进行有针对性地PCR基因检测可以以更低的成本完成检测；然而，它可能忽略一些有关家族性乳腺癌/卵巢癌的突变。因此，在本研究中我们报道了利用二代测序技术来识别新的致病性BRCA1/2变异的效用。

方法

选择位有家族性和/或只有早发性乳腺癌或卵巢癌，且是BRCA1/2阴性的女性患者。用IonAmpliSqBRCA1/2Panl扩增BRCA1和BRCA2全外显子,用IonTorrntPGM测序。

结果

通过对个DNA样本进行分析识别了个单核苷酸变异(SNVs)和32个插入缺失。其中14个SNVs和17个插入缺失被认为是致病性或疑似致病性，1个和18个致病性突变分别在之前的波兰和其他人群中被发现过，12个有害突变是未知的。8个突变是复发的,QX(BRCA1)、NI(BRCA2)和c.dlG(BRCA1)分别在8例、6例和4例患者中发现，另外2个突变(c.-2AG和c.dlCAinBRCA2)分别在3个患者中被检测到。总之，从名患者中检测出52例(10%)BRCA1/2致病性突变(图1)。

图1BRCA1和BRCA2中发现的突变。可视化的突变图谱。显示了蛋白质家族数据库蛋白结构域和特定的突变位置。两个或两个以上的突变被标记

表1为统计分析的SNV突变的数量和类型，其中8个SNV致病性突变(5个BRCA1和3个BRCA2)是以前BIC中报道过的，另外3个是VUS突变。此外研究者还发现了3个新的无意突变(见表2)和在编码区的9个新的插入缺失突变(见表3)。值得注意的是,其中一个患者携带2种致病性突变,分别命名为QX和NI，所有的致病性突变都通过Sangr测序验证。5个其他突变为疑似致病性突变，另17个突变为VUS，所有突变都是错意突变(表4)。

表1BRCA1和BRCA2中SNV的类型和数量

表2BIC和ClinVar中的致病性单核苷酸变异

表3BIC和ClinVar致病性缺失，或SIFT缺失预测

表4根据Condl算法的致病性错义突变

结论

NGS大幅度提高了拥有家族性乳腺癌/卵巢癌的波兰患者的突变检出率。

本研究中确定了两个突变，即QX（BRCA1）和NI（BRCA2），为确定波兰乳腺癌/卵巢癌患者的遗传风险奠定了基础。

信息来源：

AnnaKluska,AntaBalabas,AgniszkaPaziwska,tal.NwrcurrntBRCA1/2mutationsinPolishpatintswithfamilialbrast/ovariancancrdtctdbynxtgnrationsquncing.BMCMdicalGnomics()8:19.

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