艾上学堂苏丹教授BRCA12基因规范

2021-4-4 来源:本站原创 浏览次数:

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年,好莱坞著名女明星安吉丽娜?朱莉在《纽约时报》上发表了专栏《我的治疗选择》披露自己因为携带BRCA1基因致病突变,选择接受了双侧乳房和双侧卵巢、输卵管预防性切除术,以降低罹患乳腺癌和卵巢癌的风险。该消息一发,迅速掀起轩然大波,也使BRCA1和BRCA2基因走进了大众视野。那么,什么是BRCA1/2基因?如何规范检测及准确解读BRCA1/2基因呢?

本期“艾上学堂”BRCA网络培训班,我们非常荣幸邀请到中国科医院(医院)病理科副主任--苏丹教授为我们解答上述疑问,并详细介绍BRCA基因的规范检测流程、待检样本的选择及检测报告的解读。

苏丹教授

医学博士,研究员,博士生导师

中国科医院(医院)病理科副主任

浙江浙江省临床病理质控中心专家委员会委员,分子组副组长

浙江省智能诊断和分子技术研发中心副主任

浙江省胸部肿瘤重点实验室副主任

浙江省高层次创新人才

中国抗癌协会肿瘤病因学专业委员会委员

中国抗癌协会肿瘤精准治疗专业委员会委员

浙江省抗癌协会肿瘤病因学专业委员会副主任委员

浙江省抗癌协会肿瘤精准治疗专业委员会副主任委员

艾上学堂:苏教授您好,您能简单介绍一下BRCA1/2基因吗?

苏丹教授:BRCA1和BRCA2基因分别于年和年被发现,最初发现与遗传性乳腺癌相关,所以被命名为乳腺癌易感基因1(BRCA1)和乳腺癌易感基因2(BRCA2)。BRCA1基因位于17染色体长臂21区31带,含有24个外显子;BRCA2基因位于13染色体长臂13区1带,含有27个外显子。BRCA基因是人体内重要的抑癌基因,其编码的蛋白通过同源重组通路参与DNA双链损伤的修复,并且相关的功能蛋白能够调节细胞生长,防止可能致癌的异常细胞的分裂。流行病学研究结果显示,携带BRCA1/2基因胚系突变的人群后期会有超过60%的罹患乳腺癌和卵巢癌,BRCA1/2基因胚系突变会大大增加罹患乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌等癌症的发病风险。

艾上学堂:苏教授,目前临床针对BRCA1/2基因检测的最合适方法是什么?

苏丹教授:BRCA1/2基因序列长度大于20kb,已报道的变异位点数千个,变异可能出现在基因的任何地方,呈散在性分布,且变异类型多样(点突变、插入缺失、大片段重排等),几乎无热点突变。这些特点决定BRCA基因的检测单纯靠一代测序或者RT-PCR方法根本无法实现。具有高输出量和高解析度,能一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列读取的NGS技术成为临床上BRCA1/2基因检测的最佳选择。

艾上学堂:苏教授,BRCA1/2基因检测中,血液样本和肿瘤组织样本应该优先选择哪一种样本类型呢?

苏丹教授:基于血液样本(白细胞)DNA的BRCA检测只能检出胚系突变。基于肿瘤组织样本DNA的BRCA检测可检出胚系突变和体细胞突变(仅发生于肿瘤细胞),但是无法区分到底是体系突变还是胚系突变。中国专家共识规范了BRCA基因的检测流程,对于癌症患者建议进行体系和胚系BRCA基因配合检测,无论体系或者胚系结果为阳性均可以指导靶向用药。但是为了节约患者的医疗成本,目前检测中面临着先检测肿瘤标本还是先检测血液标本的选择,哪一种选择的成本效益更高呢?最新研究表明,在实际应用中,为了获得明确的阳性结果,先进行肿瘤样本的检测再选择性进行胚系检测来筛查家族遗传更具成本效益。先进行肿瘤样本检测,可尽快明确该个体的BRCA突变的状态,来指导患者的靶向治疗或铂类化疗,更少的患者需要两轮BRCA检测。

艾上学堂:苏教授,在临床检测中,如何实现BRCA1/2基因检测的规范化?

苏丹教授:一个规范的实验检测流程,在规范的实验室认证和质控、规范化的检测报告、遵照专家共识的标准检测流程及规范化使用有证试剂产品四个方面缺一不可。

首先,针对实验室认证及外部质控,标准的NGS实验室应符合临床实验室改进修正案(CLIA)认证要求,检测结果应由通过职业认证的临床分子遗传学家或分子遗传病理学家或相同职能的专业人员解读;另外,还要具备通过ISO或者认可的质量管理体系。实验室应该定期参加国际和国内相关室间质评项目(EQA)对实验室检测能力进行评估。

其次,要有一份规范化的检测报告,报告中应该至少包含:样本信息、检测结果、基因变异分类的详细解释、检测方法和覆盖区域、签名和联系信息,如下图报告示例。

(图片来源于《BRCA数据解读中国专家共识》)

第三,要严格遵照中国专家共识的标准检测流程进行相应的基因检测。如下两图分别是对高风险人群的标准检测流程和肿瘤患者的标准检测流程。

(图片来源于《基于下一代测序技术的BRCA1/2基因检测指南(版)》)

最后,是规范化使用有证试剂产品。我们选择的是艾德生物公司的BRCA1/2基因突变检测试剂盒---维汝健,它是目前国内临床领域第一款BRCA基因检测合规试剂盒,获得NMPA和欧盟CE认证,它的报批阶段经历了上千例临床样本的验证,产品质量有保障;检测区域包含全编码区、剪接区、启动子区、UTR区(非编码区),覆盖区域非常全面;目标区域覆盖度达到%,均一性保证所有区段都能有效测序;配合独家的数据分析系统,该系统整合了国际知名数据库和公司内部积累数据库,结合文献检索和深入分析极大方便了用户端。

总之,规范化检测是保证结果准确的基础和关键,也是我们一直倡导的理念。

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